在選擇使用陽離子聚丙烯酰胺的過程中應注意以下幾個方面：
1、絮團的大小：陽離子聚丙烯酰胺絮團太小會影響排水的速度，絮團太大會使絮團約束較多水而降低泥餅干度，我們可以通過選擇聚丙烯酰胺的分子量來調整絮團的大小。
2、污泥特性：了解污泥的來源、特性、成分和所占比重，依據性質的不同，可分為有機污泥和無機污泥兩種。一般情況下，陽離子聚丙烯酰胺用于處置有機污泥，相對的陰離子聚丙烯酰胺用于無機污泥，堿性很強時用陰離子聚丙烯酰胺，而酸性很強時不宜用陰離子聚丙烯酰胺，污泥固含量高時聚丙烯酰胺的用量也大。
3、絮團強度：絮團在剪切作用下應堅持穩定而不破碎，進一步提高陽離子聚丙烯酰胺分子量或者選擇適宜的分子構造有助于促進絮團穩定性。
4、陽離子聚丙烯酰胺的離子度：針對脫水的污泥，可用不同離子度的絮凝劑經過先做小試進行挑選，選出更適宜的聚丙烯酰胺離子度，這樣既能夠獲得更大的絮凝效果，又可使加藥量減少，節約成本。
5、陽離子聚丙烯酰胺的溶解：溶解良好才能充分發揮絮凝作用，有時需要加快溶解速度，這時可考慮提高聚丙烯酰胺溶液的濃度。
